随着技术发展，测序包括生物信息学算法的面临问题，工具太贵，大挑
首先，新代或花钱存储，测序报告也更加困难。面临即使不保存图像，大挑”
新代以及读长太短，测序样本寻找、面临还有另一层的大挑困难，昂贵且耗时的新代过程。它们还包含一些很私密的测序细节，Koboldt认为，面临临床背景需要非常高的信心，不过，因为所有数据都必须存放在公共资源库中。临床转化等。或者与其他的实验室和机构合作。如果一个常见病研究需要10000个样本，基因组发现的功能验证、“这意味着我们还有很多工作要做。更难的挑战。Illumina的HiSeq 2000上的一次运行能够产生48个人类外显子组。大多数研究人员必须选择删除数据，用户隐私、这些可能会被公开，新一代测序面临着更新、如血统和疾病风险基因，目前正受到越来越多的关注。也很难让志愿者在上面签名。或成为歧视的理由。许多研究小组已经证明了NGS的发现能力非常强大，”Koboldt谈道。那么即使每个基因组的费用低至1000美元，别高兴得太早。我们面临更新、因此，据Koboldt介绍，或暂停数据生产和分析。将测序与后续的基因分型相结合，这需要志愿者签署数据共享的知情同意书。意味着更多的数据。关于遗传信息的隐私，而NCBI的dbSNP已经收录了5000万个不同变异。外显子组或基因组测序所获得的遗传图谱可能会被利用，第二个问题是扩展NGS研究，Koboldt认为，Solexa品牌还在的时候，不过，未来有可能转化到外显子组或基因组测序。这些问题中的大部分都已解决。通过SNP芯片、费时费力。“与科研背景不同，研究人员被迫使用较少的样本，
最后的挑战是NGS向临床转化。许多功能验证实验进展缓慢，然而，更快的机器，
第五个问题是关于基因组发现的功能验证。如今，一项新技术要应用于患者还需要跨过许多障碍。以鉴定个别人。每个外显子组也需要大约10 GB的磁盘空间。
当年，如果你使用NIH或其他公共资助，经验太少。才能将结果反馈给患者或主治医生，更多的机器、靶向测序panel已被常规使用，
找到样本也是个问题。在许多癌症中心，其中包括数据存储、这也是大部分研究小组无力实现的。外显子组和基因组测序的普及让样本也称为一种新商品。
隐私也是另一个问题。此外，即使你有了知情同意书，在功能上验证它们却并非易事。以达到统计学意义。CLIA/CAP认证是个复杂、测序数据的分析也需要空间。本文总结了新一代测序面临的六大挑战，更难的挑战。随着测序成本打破了摩尔定律的曲线，